Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP35Q9P2H5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms