Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RAB9BQ9NP90 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms