Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms