Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms