Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LMO3Q8TAP4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LMO3Q8TAP4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LMO3Q8TAP4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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LMO3Q8TAP4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO3Q8TAP4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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