Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms