Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
DUX4L9Q6RFH8 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms