Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ABCB5Q2M3G0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms