Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NRF1Q16656 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms