Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SRSF5Q13243 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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