Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTPRJQ12913 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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