Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLC10A2Q12908 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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