Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KIF5AQ12840 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KIF5AQ12840 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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