Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JAG1P78504 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JAG1P78504 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms