Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HERVK_113P63121 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms