Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GPC3P51654 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms