Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK7P50613 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK7P50613 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDK7P50613 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms