Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDK8P49336 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDK8P49336 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms