Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms