Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms