Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CD247P20963 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CD247P20963 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CD247P20963 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CD247P20963 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms