Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXD8P13378 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms