Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZBED1O96006 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZBED1O96006 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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ZBED1O96006 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZBED1O96006 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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ZBED1O96006 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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ZBED1O96006 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZBED1O96006 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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