Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 STRA6-201ENST00000323940 2864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DENRO43583 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 UBE2L3-204ENST00000545681 2932 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DENRO43583 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms