Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C9orf172C9J069 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf172C9J069 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf172C9J069 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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C9orf172C9J069 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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