Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TRAF6Q9Y4K3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms