Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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PPARGC1AQ9UBK2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PPARGC1AQ9UBK2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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