Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FOXQ1Q9C009 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXQ1Q9C009 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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