Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LPIN3Q9BQK8 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms