Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SIN3AQ96ST3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms