Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CAPZA3Q96KX2 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms