Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRRN4Q8WUT4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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