Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms