Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC96Q2M329 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms