Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms