Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms