Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2FP61218 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms