Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms