Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

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Length 1,807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TSC2P49815 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TSC2P49815 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TSC2P49815 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TSC2P49815 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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