Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ACADSBP45954 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms