Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCAMP43121 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCAMP43121 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms