Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFNP31947 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms