Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms