Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP4AP20648 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP4AP20648 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms