Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NFKB1P19838 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NFKB1P19838 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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