Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTLA4P16410 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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