Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
POLKQ9UBT6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms