Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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LRFN1Q9P244 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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LRFN1Q9P244 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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LRFN1Q9P244 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LRFN1Q9P244 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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