Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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C9orf16Q9BUW7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
C9orf16Q9BUW7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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