Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LPIN3Q9BQK8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms